Первое своё выступление, которое состоялось 8 июля 1938 года в Гомеле, Пономаренко посвятил задаче «выкорчёвки врагов». В своей шифровке Сталину он просил увеличить для БССР количество репрессированных по 1-й категории (расстрел) на 2 000 человек, а по второй (тюрьма или лагерь) — на 3000. С сентября 1939 года также член Военного совета Белорусского особого военного округа, принимал участие в руководстве войсками, вошедшими на территорию Западной Белоруссии.
Перед тем, как отправиться на совещание к Павлову, Пономаренко разговаривал по телефону с обкомом — Значит вас с горкомом тоже пригласили! Странно, зачем Павлову понадобилось руководство горкома. Ладно, встретимся в штабе и все проясним. — в этот момент связь пропала и Пономаренко раздраженно кинул телефонную трубку на аппарат. Выйдя в приемную, барственно кинул помощнику — Выясни что со связью. Я к Павлову в штаб округа. У выхода его уже ждали оба секретаря. Малинин открыл дверцу автомобиля — Интересно, что еще придумал товарищ Павлов? Для чего он собрал руководство горкома и обкома?
— А вот это мы сейчас и выясним! А вот и новый нарком госбезопасности.
Цанава при виде Пономаренко кивнул — Доброго дня, Пантелеймон Панкратович!
— Лаврентий Фомич, что за безобразие со связью? Я не смог закончить разговор как ее намертво отрубило.
— Выясняю, поспешим в штаб, а со связью я обязательно разберусь и выявлю врагов народа, лишивших вас возможности вести телефонные переговоры.
Нарком НКВД Матвеев Александр Павлович догнал Цанаву и Пономаренко со свитой уже в холе — Всем доброго дня! Что у нас со связью? Хотел связаться с Москвой, но даже город недоступен.
В холле их ждал генал-майор — Здравствуйте, товарищи! Я генерал-майор Сафонов, прошу проследовать за мной.
Неожиданно прибывших окружили вооруженные люди в странной экипировке — Внимание! говорит подполковник госбезопасности Бойко. Вы все арестованы, прошу не дергаться, иначе независимо от занимаемой должности получите по самое нихачу.
Не успели первые лица республики что-то вякнуть, как их обыскали и освободили от оружия тех, кто его при себе имел. Всех завели в помещение с решетками на окнах. Здесь уже находились все члена штаба округа.
— А где товарищ Павлов? — возмутился Пономаренко.
— Ждет трибунала — ответил незнакомец, назвавшийся подполковником госбезопасности. Через девять дней Германия нападет на СССР. Примите как данность. Вам, товарищи Цанава, Матвеев и Пономаренко, предстоит подписать приказы о немедленной эвакуации семей ваших сотрудников и партийных работников а также секретной документации и архивов. А также приказ о немедленной помощи руководству округа в выделении паровозов и паровозных бригад, подвижного состава для проведения эвакуации гражданского населения.
